Лаборатория   информационных   технологий 

"Содержание"

Раздел I. Базовый информационно-вычислительный сервис для пользователей локальной сети ОИЯИ

1. Центральный информационно-вычислительный
комплекс ОИЯИ
: состояние и перспективы

Центральный информационно-вычислительный комплекс (ЦИВК) ОИЯИ в Лаборатории информационных технологий (ЛИТ) был существенно модернизирован в 2006-2007 гг. После введения в строй в 2007 г. нового суперкомпьютерного кластера ЦИВК занимает 12-е место в рейтинге самых мощных компьютерных систем в России и СНГ [1]. Оценка производительности суперкомпьютерного кластера ЦИВК ОИЯИ производилась с помощью High Performance LINPACK (HPL).

К середине 2007 г. производительность ЦИВК уже составляла 670 kSI2K, общий объем дискового пространства - 57 TB (47 TB из них для размещения каталогов пользователей, программ и файлов данных большого объема). Таким образом, к этому времени за последние полтора года суммарная процессорная мощность ЦПУ и общий объем дисковой памяти увеличились в 6,7 и 3 раза соответственно (в декабре 2007 г. объем дискового пространства увеличился до 100 ТВ). В качестве базовых операционных систем установлены Scientific Linux 4 (SL4) и Scientific Linux 3 (SL3).

Очень важным достижением следует считать обновление логической структуры ЦИВК. Прежняя структура представляла собой несколько специализированных кластеров, каждый из которых допускал использование только одним определенным образом - либо локально, либо глобально [2]. Начиная с июня 2007 г. ресурсы и сервисы ЦИВК объединены в одну общую информационно-вычислительную структуру (рис. 1). В мае 2007 г. были также существенно модернизированы логическая и программная структуры ЦИВК. Основные изменения были внесены в системы безопасности и удаленного запуска задач (batch). Теперь все ресурсы ЦИВК - вычислительные и хранения данных - могут использоваться как локальным образом, так и глобально (для распределенных вычислений - как часть инфраструктуры LCG/EGEE) всеми проектами, в которых участвуют физики ОИЯИ. Системное программное обеспечение оптимизировано таким образом, чтобы обеспечить наиболее эффективное использование вычислительных ресурсов вместе с максимально защищенным и в то же время наиболее универсальным доступом к данным. Для распределения и учета использования ресурсов используются batch-система Torque и планировщик Maui.

Рис. 1. Схема организации, доступа и поддержки вычислительных ресурсов ЦИВК:

SL3/32 Int/UI - интерактивные узлы с пользовательскими интерфейсами на базе 32-битной архитектуры с операционной системой SL3,

SL4/32 Int/UI - интерактивные узлы с пользовательскими интерфейсами на базе 32-битной архитектуры с операционной системой SL4,

SL4/64 Int/UI - интерактивные узлы с пользовательскими интерфейсами на базе 64-битной архитектуры с операционной системой SL4,

LCG-RB - LCG Resource Broker,

LCG-CE - LCG Computing Elements,

WN - Worker Nodes,

X509 PX - Proxy,

VObox - выделенные узлы, на которых запущены специализированные агенты и сервисы виртуальных организаций (VO) - ALICE, CMS, etc. - для выполнения специфических для каждой VO служебных функций,

AFS - серверы AFS,

dCashe - серверы dCashe

Доступ к данным обеспечивается системой dCache и частично - NFS. Доступ к программам общего назначения и домашним каталогам пользователей обеспечивает файловая система Andrew File System (AFS). Для регистрации и авторизации пользователей используется система Kerberos V, заменившая Kerberos IV. Эта замена была вызвана необходимостью уйти от слабой защищенности Kerberos IV, дающей возможность декодировать закрытые данные, используя современные мощные процессоры. Переход на новые протоколы потребовал значительных изменений в настройках всех компьютеров ЦИВК. Так как batch-система существенным образом зависит от системы авторизации, в стандартную систему Torque пришлось внести дополнения на уровне исходных кодов для работы с новыми протоколами. Интеграция Kerberos V и AFS в систему Torque оказалась весьма непростой. Одна только настройка планировщика, потребовавшая подобрать значения около 500 параметров, заняла около десяти дней полномасштабных тестов.

В конфигурацию вычислительной составляющей ЦИВК также были внесены изменения. Вместо разделения ресурсов на ферму для WLCG и ферму для локального использования, все компьютеры были объединены в одну общую структуру. Для этого потребовалось внести значительные изменения в стандартное программное обеспечение LCG - систему gLite, потому что в стандартном варианте gLite позволяет назначать ресурсы для использования только в глобальной структуре LCG/EGEE. Это, в свою очередь, потребовало изменить большое число параметров batch-системы, что само по себе требует длительного времени.

К осени 2007 г. комплекс ЦИВК включил в себя следующие узлы:

    • 53 специализированных сервера (из них 29 для поддержки инфраструктуры ЦИВК и ОИЯИ и 24 для поддержки инфраструктуры грид-сайта JINR-LCG2 - RDIG, WLCG и EGEE);
    • 4 интерактивных узла;
    • 60 компьютеров 64-битной архитектуры (по два Xeon 5150 dual-core, 8 GB RAM, 160 GB диск, 1 Gb Ethernet);
    • 5 компьютеров 32-битной архитектуры (по два Athlon 2400+, 2GB RAM, 40 GB диск, 1Gb Ethernet, сетевой адаптер Myrinet).

Так как двуядерный процессор - это, фактически, два независимых процессора, то можно считать, что всего имеется 240 ЦПУ 64-битной архитектуры, образующих основную часть суперкомпьютерного кластера ЦИВК и десять 32-битных ЦПУ.

Пользователи ОИЯИ могут запускать задачи на всех 250 ЦПУ как в локальном режиме, так и в глобальном (в среде LCG/EGEE). Почти вся внутренняя сеть ЦИВК базируется на Gigabit Ethernet. Все основные вычислительные и дисковые ресурсы объединены с помощью шлюзов с пропускной способностью 1 Gb/с. Соединение внутренней сети ЦИВК с общей сетью ОИЯИ и внешним шлюзом также имеет пропускную способность 1 Gb/с.

Для интерактивной работы пользователи имеют четыре компьютера: два 64-битных (Core 2 Duo, 4 GB RAM, 250 GB HDD, 1 Gb Ethernet) и два 32-битных (Dual Athlon 2400+, 2 GB RAM, 80 GB HDD, 1 Gb Ethernet).

Серверы специального назначения обеспечивают работу пользователей и общих сервисов: batch, WWW, базы данных MySQL и Oracle, e-mail, DNS и некоторые другие. Они имеют различную архитектуру - от 32-битных Pentium-3 до 64-битных Core 2 Duo.

Для домашних каталогов пользователей и программ общего назначения используется распределенная файловая система AFS. Общий объем дискового пространства в AFS составляет около 1.45 TB (из них 1.40 TB - на серверах ЦИВК). Всего в ЦИВК имеется 8 серверов AFS. Данные, хранящиеся на дисковых серверах ЦИВК, можно разделить на две категории:

    • домашние каталоги пользователей и различные программные пакеты;
    • “физические” данные, т.е. данные, полученные с экспериментальных установок, и симулированные данные, хранящиеся в dCache.

Система dCache полностью заменила систему CASTOR. Серверы CASTOR выведены из обращения, доступ к данным в этом формате больше в ОИЯИ не поддерживается. dCache была выбрана в качестве системы хранения данных, потому что она наилучшим образом отвечает требованиям, предъявляемым к ОИЯИ как центру Tier-2 в иерархии среды WLCG (Worldwide LHC Computing Grid). Программно-аппаратный комплекс dCache служит для хранения данных большого объема. Он включает в себя один сервер для управления аппаратурной частью, пять front-end серверов для мониторирования системы и работы с данными и 14 серверов хранения данных (back-end, или дисковый пул). Используются платформы Athlon 2000+, Pentium 4, Pentium D и Xeon. Все подсистемы хранения данных основаны на аппаратно реализованном механизме RAID5. Для внутренних соединений в подсистемах использован 1Gb Ethernet. Все front-end системы также объединены с помощью 1Gb Ethernet. В настоящее время общий объем дискового пространства dCache составляет около 82 TB, а в ближайшее время планируется увеличить его до 90 TB. Функционирование системы dCache постоянно мониторировалось и проверялось в течение 2006-2007 гг. тестирование будет продолжено с целью определения готовности к приему физических данных с экспериментальных установок после запуска LHC. Тесты показывают, что отдельный файл размером 1-2 GB может быть передан в ОИЯИ из ЦЕРН и других научных центров Европы (с помощью средств грид) со скоростью 2-4 MBps. Эта скорость не деградирует существенно при передаче нескольких файлов одновременно, и суммарная скорость параллельной передачи данных достигает 30 Mbps. В течение последних шести месяцев в систему dCache ОИЯИ ежедневно перекачивается 1-1.5 TB тестовых данных. На рис. 2 показана достигнутая скорость передачи за период 29.09.2007 г. - 12.10.2007 г. во время тестовой передачи данных CMS.

Рис. 2. Усредненная скорость передачи ЦЕРН-ОИЯИ во время тестовой передачи данных CMS

Как и система AFS, dCache обеспечивает и локальный, и глобальный доступ к файлам, которые объединены в одну логическую файловую систему, но могут находиться на различных физических дисках. В локальной среде Linux в ОИЯИ возможно подмонтирование таких файловых систем в файловую систему Linux, обеспечивая таким образом возможность манипулировать файлами, но без доступа к их содержимому. В отличие от AFS, dCache использует свои собственные протоколы для доступа к данным - DCAP или gridFTP.

В глобальной среде грид используется инструментарий более высокого уровня - FTS, SRM and Xrootd. dCache ориентирована на работу с данными в режиме WORM (Write Once, Read Many) - записать однажды, читать много раз. Для работы с файлом необходимо, как правило, скопировать его в локальное файловое пространство. Имеется также возможность доступа к файлам из приложений, используя библиотеку libdcap. К сожалению, dCache версии 1.7.0.39 не поддерживает механизм квотирования, но ожидается, что новая версия с поддержкой квотирования будет выпущена в ближайшее время. Руководство по использованию dCache и полная текущая информация о системе опубликована на веб-сайте ЦИВК [3]. dCache является единственной в ОИЯИ системой хранения больших объемов данных. Ресурсы ЦИВК, включенные в инфраструктуру EGEE/LCG и RDIG (Russian Data Intensive Grid), интенсивно и успешно использовались в течение 2006-2007 гг. и составили 27% общих ресурсов RDIG (январь 2006 г. - октябрь 2007 г.), а после ввода в строй нового суперкомпьютерного кластера (начиная с июня 2007 г.) - больше 47% (см. рис. 3 и 4).

Рис. 3. Нормализованное время ЦПУ в инфраструктуре RDIG (январь 2006 г. - октябрь 2007 г.)

Рис. 4. Нормализованное время ЦПУ в инфраструктуре RDIG (июнь-декабрь 2007 г.)

Показатели дальнейшего развития, основанные на научных планах ОИЯИ, проиллюстрированы табл. 1.

Таблица 1

Год

2007

2008

2009

2010

ЦПУ (kSI2K)

 670

1250

1750

2500

Диски (TB)

 100

 400

  800

1200

Ленты (TB)

-

-

  100

 200

 

Библиографический список

1. http://www.supercomputers.ru/?page=rating.

2. N.S. Astakhov, V.V. Ivanov, V.V. Korenkov, V.V. Mitsyn, A.P. Sapozhnikov, E.A. Tikhonenko, The JINR CICC resources and services: current status and perspectives, LIT JINR Scientific Report 2004-2005, Dubna, 2005, pp. 33-36.

3. http://lit.jinr.ru (Computing&Information Resources ® CICC ® News).

В. Иванов (ivanov@jinr.ru)

В. Кореньков (korenkov@cv.jinr.ru)

В. Мицын (vvm@cv.jinr.ru)

Н. Астахов (Nikolai.Astakhov@jinr.ru)

Е. Тихоненко (eat@cv.jinr.ru)

В. Трофимов (tvv@jinr.ru)

 

 

 

 

 

 

"Содержание"

2. Библиотеки и пакеты прикладных программ, доступные пользователям ОИЯИ

Подробная информация о библиотеках и пакетах прикладных программ, доступных пользователям ОИЯИ, размещена на сайте http://www.jinr.ru/programs/

Библиотека программ JINRLIB

JINRLIB - библиотека программ, предназначенных для решения широкого круга математических и физических проблем, возникающих в ходе научной деятельности сотрудников ОИЯИ. Пополнение библиотеки происходит новыми программами, создаваемыми сотрудниками ОИЯИ и их коллаборантами. Библиотека распространяется в виде объектных модулей и в виде самостоятельных пакетов прикладных программ. На странице http://www.jinr.ru/programs/jinrlib/ можно найти тексты и описания программ и программных пакетов, библиотеки объектных модулей.

Пакеты прикладных программ (новые версии), появившиеся в течение 2007 г.:

GLUPLOT

Программа для визуализации данных, версия 1.5.
Автор - А.Г. Соловьев

FITTER

Программа для фитирования экспериментальных данных,
версия 2.1.0.
Авторы - А.Г. Соловьев, А.В. Стадник, А.Х. Исламов, А.И. Куклин

RC

Набор шаблонов для управления конфигурационными файлами,
версия 1.7.
Автор - А.Г. Соловьев

CREATE
JINRLIB-ENTRY

Генератор стандартной страницы для библиотеки "JINRLIB",
версия 1.2.
Автор - А.Г. Соловьев

DFM-POT

Программа расчета ядро-ядерного потенциала в рамках модели
двойного фолдинга.
Автор - К.В. Лукьянов

PATTERN
ANALIZER

Программа регистрации дальних корреляций с помощью вейвлет-преобразования, версия 0.2.
Автор - А.Г. Соловьев

SAS

Программа для первичной обработки спектров малоуглового
рассеяния, версия 3.1.6.
Авторы - А.Г. Соловьев, Т.М. Соловьева, А.В. Стадник,
А.Х. Исламов, А.И. Куклин

HTL

Библиотека шаблонов для одномерных гистограмм, версия 1.8.
Автор - А.Г. Соловьев

Для вычислительной фермы ЦИВК ОИЯИ библиотеки объектных модулей математических программ общего назначения JINRLIB подготовлены:

    • для ОС Scientific Linux 4.4 с архитектурой CPU x86_64 - для трансляторов g77 (GNU Fortran 77 compiler), gfortran (GNU Fortran 95 compiler), ifort (Intel Fortran Compiler);
    • для ОС Scientific Linux 4.4 с архитектурой CPU i386 - для трансляторов g77 (GNU Fortran 77 compiler), gfortran (GNU Fortran 95 compiler);
    • для ОС Scientific Linux 3.0.x с архитектурой CPU i386 - для g77 (GNU Fortran 77 compiler).

Библиотеки объектных модулей для ОС Windows 9X/NT/2000/XP подготовлены для трансляторов GNU Fortran 77, Compaq Visual Fortran 6.6, Fortran PowerStation 4.0, Microsoft Fortran 5.00.

Для использования на компьютерах с ОС Windows 9X/NT/2000/XP библиотеку JINRLIB нужно записать в одну из директорий и указать путь к этой директории при вызове компилятора. Если библиотека записана, например, в директории d:\fortran\lib, то ссылка на библиотеку с использованием переменной окружения PLACE=d:\fortran\lib будет выглядеть так: %PLACE%\jinrlib.lib.

Вызов библиотеки объектных модулей JINRLIB:

Scientific Linux
g77
(lxpub01-lxpub07)

Вызов компилятора:
g77 myprog.f -L/usr/libexec/CERNLIB/jinr -ljinr
или:
g77 myprog.f -L$CERN/jinr -ljinr
Просмотр содержимого библиотеки:
ar t $CERN/jinr/libjinr.a

Scientific Linux
gfortran
(lxpub01-lxpub03)

Вызов компилятора:
gfortran myprog.f -L$CERN/jinr -ljinr95

Scientific Linux
ifort
(lxpub01-lxpub02)

Вызов компилятора:
ifort myprog.f -L$CERN/jinr -ljinri

Windows
9X/NT/2000/XP,
GNU Fortran 77

Вызов компилятора в командной строке:
g77 myprog.for %PLACE%\libjinr.a
Просмотр содержимого библиотеки:
ar t %PLACE%\libjinr.a

Windows
9X/NT/2000/XP,
Compaq Visual Fortran 6.6

Вызов компилятора в командной строке:
fl32 myprog.for %PLACE%\jinrlib.lib
В оконном режиме:
в Project/Settings/Link в Object/Library modules добавить jinrlib.lib, указав полный путь.
Просмотр содержимого библиотеки:
lib /list %PLACE%\jinrlib.lib

Windows
9X/NT/2000/XP,
Fortran PowerStation 4.0

Вызов компилятора в командной строке:
fl32 /MD myprog.for %PLACE%\jinrlib.lib
В оконном режиме:
в Build/Settings.../Link в Object/library modules добавить jinrlib.lib, указав полный путь.
Просмотр содержимого библиотеки - так же

Windows
9X/NT/2000/XP,
MicroSoft Fortran 5.00

Вызов компилятора в командной строке:
fl myprog.for %PLACE%\jinrlib.lib
Просмотр содержимого библиотеки:
lib %PLACE%\jinrlib.lib , con
или:
lib %PLACE%\jinrlib.lib , listlib.txt

Библиотека программ CERNLIB

Библиотека CERNLIB (http://wwwinfo.cern.ch/asd/index.html) - большая коллекция программ, поддерживаемых и распространяемых на исходном языке, в объектном коде и в виде готовых программ. Большинство этих программ разработано в CERN и ориентировано на решение физических и математических проблем. Описания программ можно найти в Short_write-up (http://wwwinfo.cern.ch/asdoc/cernlib.html) и более подробно в Long_write-up (http://wwwinfo.cern.ch/asdoc/Welcome.html).

Библиотека CERNLIB в ЦИВК ОИЯИ размещается в директории /usr/libexec/CERNLIB/, где можно найти исходные тексты, библиотеки, исполняемые файлы и т.д., включая файл README с соответствующими режимами компиляции. С дополнительной информацией можно познакомиться на сайтах http://www.jinr.ru/programs/cernovr.htm и http://lit.jinr.ru в разделе ЦИВК.

Библиотека программ CPC

CPCPL - международная библиотека программ журнала Computer Physics Communications (CPC) - в настоящее время является одним из самых представительных и хорошо организованных банков программ, решающих задачи физики, математики, химии и других смежных областей знаний. Программы распространяются в текстовом виде. Подробные описания программ публикуются в журнале CPC. Каждая программа имеет свой четырехсимвольный идентификатор (Catalogue Identifier) и краткое описание.

ОИЯИ имеет подписку на журнал СРС и библиотеку программ с 1970 г. Журнал находится в читальном зале научно-технической библиотеки ОИЯИ. По лицензионному соглашению с СРС сотрудники ОИЯИ имеют доступ к общей информации и к программам библиотеки по e-mail и через WWW-сервер - http://www.cpc.cs.qub.ac.uk/cpc/. При электронном способе заказа требуется указать идентификатор программы. Программа будет предоставлена, если IP-адрес Вашего компьютера начинается с 159.93. Заказывая программу по e-mail, нужно сообщить идентификатор программы и Ваш e-mail адрес, который должен содержать jinr.ru.

Один раз в год ЛИТ получает CD-ROM с текстами программ, опубликованных в течение предыдущего подписного года. Более подробную информацию о CPC-библиотеке в ОИЯИ, каталог и описания программ можно найти на страницах:

http://www.jinr.ru/programs/cpcins.htm,   http://www.jinr.ru/programs/cpc_ind.htm.

По вопросам, касающимся библиотеки JINRLIB, можно обращаться к Л. Попковой (lyuda@jinr.ru) и Т. Сапожниковой (tsap@jinr.ru), по библиотеке CPCLIB - к Р. Федоровой (Fedorova@jinr.ru).

Т. Сапожникова (tsap@jinr.ru)

"Содержание"

3. Настольная информационная среда
Physics Information Systems and Data Bases”

Введение

Результат любой научной работы, будь то экспериментальной или теоретической, находит свое выражение в публикациях в научных журналах. Но прежде чем отправить рукопись статьи в редакцию журнала, научный работник проводит кропотливую работу с литературой, имеющей отношение к исследуемой проблеме. Традиционное хождение в читальный зал библиотеки и требующие значительного времени поиски нужной ссылки в каталожных ящиках ушли в прошлое. Внедрение современных компьютерных и телекоммуникационных технологий, и особенно информационных технологий, позволяет качественно изменить организацию информационных ресурсов, их хранение и обеспечение доступа к ним. Благодаря этому научный сотрудник, пользуясь Интернетом, может в считанные секунды найти нужную ему ссылку, загрузить по сети интересующую его статью, отправить рукопись статьи в редакцию журнала. Необходимым условием эффективности научной деятельности в современном мире является оперативный доступ к информации. Для выполнения этой задачи на сайте ОИЯИ была создана информационная среда “Physics Information Systems and Data Bases”. На сервере dbserv.jinr.ru, реализованном в ЛИТ ОИЯИ по проекту развития сети баз данных и знаний в области фундаментальных свойств материи и прикладной ядерной физики, читатель данной статьи найдет необходимые гиперссылки к упоминаемым в тексте серверам, базам данных и информационным системам. В конце статьи дается информация о Едином реестре научных публикаций, разработанном в Научной электронной библиотеке (НЭБ) для облегчения работы российских ученых по учету и сбору публикаций.

Настольная информационная среда

Для повышения эффективности работы с библио- и фактографической литературой на сайте ОИЯИ функционирует веб-страница Physics Information Servers and Data Bases (http://dbserv.jinr.ru/~genis/Infpublish.htm), представляющая собой информационную среду для оперативного доступа сотрудников ОИЯИ к научно-технической информации в Интернет. Она включает ссылки на энциклопедии, справочники, базы данных по физике частиц и ядер, книжные Интернет-магазины, предоставляет доступ к полнотекстовым журналам российских и зарубежных издательств и т.п. В ней представлены также справочные материалы для подготовки рукописей, направляемых затем автором в электронный архив публикаций или в редакцию журнала.

Раздел Physics Web Servers содержит ссылки на серверы организаций, институтов и университетов, ориентированные на исследования по физике и рассматриваемые в сети как распределенные базы данных библиографической и фактографической информации.

Российские сайты Scientific.RU и Elementy содержат новости в различных областях науки, отражают состояние науки в России, также на первом сайте публикуются индексы цитируемости российских ученых. Самые свежие новости в области физических исследований можно получать (по электронной почте) с сервера Physics News Американского института физики (AIP).

Различные руководства, энциклопедии и справочники по математике, информационным технологиям, физике, химии и технике, некоторые из которых реализованы средствами мультимедиа, можно найти в разделах Handbooks, Encyclopedias. Руководства по языкам программирования C и Fortran для численных вычислений доступны на сайте Лос Аламосской Национальной лаборатории по ссылке Numerical Recipes. Многочисленные программы и пакеты для аналитических и численных вычислений, коды моделирования ядерно-физических процессов, средства подготовки публикаций и построения графиков размещены на сервере Physics Related Software Джефферсоновской лаборатории.

Информационный бюллетень History of Physics, издаваемый два раза в год Американским институтом физики, содержит публикации о выдающихся физиках, по истории физики и смежных областей науки.

такие необходимые в повседневной работе сведения, как электронные адреса интересующих вас людей, институтов, организаций, сведения о проводимых экспериментах, предстоящих конференциях можно получить по имеющимся ссылкам на соответствующих сайтах.

Ссылки на фактографические базы данных, содержащие материалы, используемые в повседневной работе научных сотрудников, размещены в разделах High Energy Physics и Low Energy Physics. Эти материалы представляют различные программные коды моделирования и анализа, учебные программы, базы данных с результатами физических экспериментов, характеристики действующих экспериментальных установок и т.п.

Physics Information Servers and Data Bases

Physics Web Servers - физико-математические серверы в России и за рубежом.

Scientific.RU (www.scientific.ru) - российский научный сервер - новости науки, индекс цитируемости российских ученых.

Elementy (elementy.ru) - русскоязычный научно-популярный информационный сервер.

Physics News (www.aip.org/physnews/update) - сервер самых свежих новостей по физике, поддерживаемый Американским институтом физики.

Handbooks, Encyclopedias - руководства, справочники и мультимедийные энциклопедии по физике, математике, химии, информатике и инженерным наукам. Периодическая таблица элементов.

Numerical Recipes (www.nrbook.com/nr3) - Books in C, Forntran 77, and Fortran 90 On-line.

Physics Related Software (www.jlab.org/~semenov/rlinks/soft.html) - прикладные программы, используемые для моделирования и расчетов в физике высоких энергий (на сайте Джефферсоновской лаборатории, США).

CERN home site - сайт ЦЕРН.

CERN Courier - журнал ЦЕРН по физике высоких энергий.

History of Physics - бюллетень по истории физики, издаваемый Американским институтом физики.

Institutions around the World - URL-адреса физических центров в России и за рубежом.

Experiments over the World - адреса крупных экспериментальных установок в физических центрах в России и за рубежом.

HEP names, e-mail addresses - база данных (SLAC) электронных адресов специалистов, работающих в физике высоких энергий.

Physics Conferences, Workshops and Schools - база данных (SLAC) конференций.

International Center for Fundamental Physics in Moscow.

RFBR - Российский фонд фундаментальных исследований.

High Energy Physics (HEP) - раздел физики высоких энергий (ФВЭ). Включает текущие новости, учебные материалы, информацию о центрах ФВЭ, пакеты прикладных программ для моделирования и обработки данных, графики и таблицы измеренных данных. Содержит ссылки на библиографические и фактографические базы данных в области ФВЭ.

Low and Medium Energy Physics - раздел физики низких и промежуточных энергий. Включает ссылки на серверы с библиографическими и фактографическими данными по структуре ядер и их распадам, ядерным реакциям, групповым константам, захвату нейтронов и др. Этот сервис поддерживается Национальным центром ядерной информации (NNDC) Брукхевенской национальной лаборатории (BNL) и Секцией ядерных данных (NDS) Международного агентства атомной энергии (IAEA).

Раздел Publishing Offices

Главная цель раздела Publishing Offices, составляющего основу настольной информационной среды, предоставлять доступ как к библиографическим базам, так и к полным текстам электронных книг, журналов, справочников, энциклопедий и других источников. Размещенная там страница новостей информирует читателей о новых доступных электронных ресурсах, об изменениях в условиях доступа к имеющимся ресурсам. Пользователь, чтобы получить доступ к базам данных российских и зарубежных журналов, должен зарегистрироваться. Это вызвано необходимостью защиты от неконтролируемого копирования полнотекстовых журналов, что категорически запрещается лицензионными правилами. Кликнув на надпись Registration пользователь выходит на страницу с информацией о порядке регистрации и лицензионных правилах. Доступ к сайтам издательств предоставляется только через прокси-сервер ОИЯИ. Для получения учетной записи необходимо обратиться в сетевую службу ОИЯИ по адресу elibs@jinr.ru, указав свои данные и предполагаемые username и password. После получения учетной записи необходимо сконфигурировать браузер следующим образом:

Для настройки в Internet Explorer в пункте меню Сервис® Свойства Обозревателя-Подключения нажмите на кнопку Настройка LAN”. Установите галочку в разделе Прокси-сервер, в поле Адрес введите proxy.jinr.ru, в поле порт” - 3128. Нажмите на кнопку Дополнительно”, установите галочку Один прокси-сервер для всех протоколов”.

Для настройки в Mozilla Firefox зайдите в меню Инструменты”, пункт Настройки, раздел Дополнительно”. Нажмите кнопку Настроить”. Выберите "Настроить параметры подключения прокси вручную”. В поле HTTP-прокси” укажите proxy.jinr.ru, в поле порт” - 3128.

В разделе имеются две секции: Section for Authors и Retrieval Servers and Data Bases. В секции Section for Authors размещены различные материалы, необходимые авторам при подготовке публикаций. Это руководства для создания рукописей в формате LaTeX, схемы классификации, импакт-факторы российских и зарубежных журналов, список реферируемых журналов, рекомендуемых ВАК, принятые сокращения названий журналов, архивные серверы по физике и математике, куда можно направлять свои рукописи до опубликования в журнале. Для работ по математике это серверы The Mathematical Reviews Submission server, The Mathematical Physics preprint server и Mathematics Preprint Server. Работы в различных областях физики направляются на сервер ArXiv preprint server, который разделен на многочисленные секции: феноменология, конденсированные среды, теоретическая ядерная физика, экспериментальная ядерная физика и т.д.

Секция для авторов

How to prepare document in (La)TeX - программы, справочники и руководства для подготовки публикации в научных журналах в формате TeX.

PACS (Physics and Astronomy Classification Scheme) - библиографическая классификационная схема по физике и астрономии.

Imact Factor - импакт-факторы российских и зарубежных журналов.

The list - список реферируемых российских и зарубежных журналов, рекомендуемых BAK.

Journal Abbreviation Index - сокращенные названия научных журналов.

Glossary - словарь английских математических терминов.

Russian-English, English-Russian Dictionary and Translator.

ArXiv preprint server - сервер электронных публикаций (препринтов) по физике, математике, нелинейным наукам, компьютерным и другим смежным наукам. Пользуясь инструкциями, авторы могут выставлять свои статьи на сервере.

The Mathematal Reviews Submission server - специализированный сервер электронных публикаций по математике, поддерживаемый Американским математическим обществом.

The Mathematical Physics preprint server - сервер препринтов по математической физике. Поддерживается Техасским университетом.

The Mathematics preprint server - сервер препринтов по математике.

Поисковые серверы и базы данных

Секция Retrieval Servers and Data Bases содержит ссылки на поисковые серверы и библиографические и фактографические базы данных публикаций. Наиболее полной является библиографическая база Web of Knowledge, поддерживаемая Институтом научной информации (ISI) в Филадельфии. Для математиков большой интерес представляют базы данных Zentralblatt Math и MathSciNet, причем вторая связывает библиографические ссылки с полнотекстовыми. Более полно представлены информационные ресурсы по физике. Если требуемая журнальная статья по каким-либо причинам недоступна, то соответствующую публикацию в виде препринта можно найти в одном из библиотечных каталогов CERN, DESY, SLAC, KEK.

ОИЯИ осуществляет подписку на зарубежные журналы через корпорацию EBSCO, которая предоставляет различный информационный сервис, в том числе и доступ к полным текстам электронных версий журналов многих издательств. Наиболее активно используемый читателями ОИЯИ и поддерживаемый SLAC сервер публикаций SPIRES сочетает поисковую систему и базу данных публикаций, экспериментов, конференций, адресов и т.п. Полнотекстовые публикации по любой физической тематике могут быть загружены из архивного сервера ArXiv. Большое количество полнотекстовых журналов доступно на сайте Научной электронной библиотеки elibrary.ru.

ОИЯИ участвует в поддержке международной ядерной информационной системы INIS, которая предоставляет библиографическую информацию по ядерной физике и технологии. В последнее время эта система была дополнена полнотекстовой базой так называемой неконвенциональной литературы” (NCL) которая включает отчеты, материалы конференций, препринты, журнальные статьи и т.п.

EMIS - европейский математический информационный сервис, поддерживаемый Европейским математическим обществом. Включает поисковые средства, библиографические и фактографические базы данных, полнотекстовые электронные журналы, монографии, записи лекций, труды конференций и т.п. Чтобы использовать все возможности EMIS, нужно войти на сайт Scientific Electronic Library (elibrary.ru) и выбрать секцию "Data bases".

MathSciNet Search Service - библиографический сервер по математике, поддерживаемый Американским математическим обществом. Библиографические ссылки содержат указания на полнотекстовый источник.

Zentralblatt MATH - библиографический сервер по математике. Содержит реферативную базу публикаций по чистой и прикладной математике. Сервер доступен через сайт Scientific Electronic Library (elibrary.ru).

CERN Library Catalog.

DESY Library Catalog.

JINR Library Catalog.

SLAC Library Catalog.

EBSCO - Electronic Journal Service - сервер электронных журналов, поддерживаемый консорциумом EBSCO. Через этот консорциум НТБ ОИЯИ осуществляет подписку на журналы, в том числе на их электронные версии.

E-Print Network Search Engine - сервер всевозможных электронных материалов, опубликованных во всем мире. Поддерживается Департаментом Энергетики США (DOE).

HEP preprint servers: CERN, DESY, KEK, SLAC - серверы препринтов по физике промежуточных и высоких энергий.

SPIRES Search interface (SLAC Server) - сервер баз данных по электронным адресам ученых-физиков, институтов, конференций, экспериментов, публикациям по физике высоких энергий, включающий также и поисковый сервер.

ArXiv server in ITEP - "зеркало" сервера ArXiv Los Alamos Physics Information Server - поисковый сервер электронных публикаций (препринтов) по физике, математике, нелинейным наукам, компьютерным и другим смежным наукам.

SCIRUS - поисковый сервер публикаций в научных журналах, поддерживаемый издательством Elsevier.

Scientific Electronic Library - сервер полнотекстовых журналов по всем областям наук, поддерживаемый консорциумом "Научная электронная библиотека".

INIS - раздел, содержащий ссылку на Международную ядерную информационную систему, включающую библиографическую базу ядерных данных и полнотекстовую базу так называемой “неконвенциональной литературы” (NCL) по ядерной физике и технологии. В этом разделе дана инструкция использования полнотекстовой базы NCL.

Encyclopedias and Handbooks - руководства, справочники и мультимедийные энциклопедии по физике, математике, химии, информатике и инженерным наукам. Периодическая таблица элементов.

Издательства

В разделе Publishing Offices приведены ссылки, через которые читатель выходит на списки доступных полнотекстовых журналов соответствующих издательств. Часть полнотекстовых журналов доступна для читателей ОИЯИ по подписке, другая часть - благодаря членству ОИЯИ в различных консорциумах. Доступность к полным текстам того или иного журнала зафиксирована дополнительной надписью “full text” против названия журнала. Многие российские журналы (например издательства МАИК/НАУКА) переводятся на английский язык и тиражируются издательством Springer. На сайте этого издательства читатели имеют доступ не только ко всем полнотекстовым журналам по тематике ОИЯИ, но и электронным версиям книг, изданных в 2005-2007 гг. Ссылки на отдельно издаваемые журналы (не принадлежащие крупным издательствам) помещены в разделе Selected Journals. Адреса электронных книжных магазинов, через которые читатели могут заказывать заинтересовавшие их книги, приведены в разделе Internet BookShops.

Ниже приводится список серверов, доступ к которым можно реализовать через ссылки из раздела dbserv.jinr.ru/~genis/.

American Chemical Society

American Institute of Physics

American Mathematical Society

American Physical Society

Editions de Physique (EDP) Sciences

Elsevier

IEEE

Institute of Physics Publishing

JINR Publishing Department

Kluwer Academic/Plenum Press

Maik/Nauka Publishers

Nature Publishing Group

Springer Science Online

Taylor & Francis

World Scientific

Wiley Interscience

Selected Journals

Internet BookShops

ЕРНП - Единый реестр научных публикаций

Для облегчения работы научного сотрудника по сбору и учету публикаций Научная электронная библиотека (elibrary.ru) предлагает использовать Единый реестр научных публикаций (ЕРНП) российских ученых. ЕРНП - база данных и поисковая система по публикациям российских ученых в периодических изданиях, монографиях, сборниках и т.п.

Регистрация в реестре:

    • Зайдите со своим именем в elibrary.ru.
    • Выберите в меню Индекс цитирования ® Регистрация в реестре и зарегистрируйтесь в Едином реестре.
    • Для просмотра ваших статей, включенных в реестр, нажмите кнопку Ваши публикации.
    • Для включения публикаций в реестр выберите в меню пункт Регистрация публикаций и введите данные о своей публикации.

По проекту, публикации (как в российских, так и зарубежных источниках) зарегистрированных пользователей должны заноситься автоматически.

В дальнейшем предполагается установить в ОИЯИ "зеркало" этой базы.

Ж. Мусульманбеков (genis@jinr.ru)

"Содержание"

4. Библиографическая система EndNote

Назначение и возможности

    • EndNote является поисковой системой - позволяет очень быстро осуществлять поиск в электронных библиографических базах и загружать ссылки прямо в имеющуюся или вновь созданную библиотеку EndNote.
    • EndNote является средством подготовки статей и библиографии - при написании статьи организует ссылки, рисунки и таблицы в Microsoft Word с помощью свойства Cite While You Write.
    • EndNote позволяет создавать библиографию с помощью свойства Format Paper и в среде других текстовых процессоров.

Библиотека EndNote

    • Является коллекцией библиографических записей (БЗ), содержащих информацию, необходимую для создания библиографии.
    • БЗ могут содержать также ключевые слова, записи, абстракты.
    • Нет ограничений на количество БЗ в одной библиотеке.
    • Нет ограничений на количество создаваемых библиотек.
    • Дополнительные документы (рисунки, таблицы, аудио-, видео-файлы, полные тексты), прикрепляемые к БЗ, хранятся в разделе [library name].DATA.
    • Имя файла библиотеки содержит расширение .ENL.

Создание библиотеки

    • Можно создавать неограниченное количество библиотек, однако для удобства пользователю рекомендуется иметь одну библиотеку.
    • В готовую библиотеку можно заносить БЗ.
    • Закачивать в нее БЗ, найденные в различных базах данных.
    • Сортировать, редактировать БЗ и т.п.
    • Созданную библиотеку необходимо спасти в выбранную вами директорию; при этом автоматически создается раздел с расширением .DATA для полнотекстовых файлов, рисунков, таблиц и т.п.

Создание и редактирование БЗ

Что такое БЗ?

    • БЗ содержит ключевые слова, название статьи, книги, фамилии авторов, год и место издания, ISSN, ISBN, абстракт статьи, URL, DOI и т.п.
    • Кроме того, БЗ может включать рисунки, таблицы, аудио и видео файлы, полные тексты статей или книг.
    • Каждой БЗ, добавляемой в библиотеку, присваивается уникальный номер, который используется при подготовке рукописи статьи. Пользователь не может изменить этот номер.
    • Нет ограничений на количество БЗ в одной библиотеке.
    • В EndNote встроено 39 типов БЗ, в том числе журнальная статья, книга, труды конференций и т.п.

В любой БЗ поля (автор, название, дата и т.п.) могут быть изменены или удалены пользователем.

Поиск библиографии в базах данных

    • EndNote обеспечивает доступ к удаленным библиографическим базам посредством протокола запросов “Z39.50”, который широко используется библиотеками по всему миру.
    • EndNote содержит информацию, необходимую для соединения с конкретными библиографическими базами в файлах настройки - "connection files".
    • Поиск библиографии в доступных базах осуществляется с помощью команды "Online Search".
    • Затем из списка выбирается конкретная база, на которую будет послан поисковый запрос.
    • В окне поисковых запросов набирается формула запроса.
    • В случае положительного исхода в окне "Retrieved References" высвечиваются найденные ссылки.
    • Результаты поиска (выборочно) заносятся в персональную библиотеку EndNote.

Demo-версию пакета, которая функционирует в течение 30 дней, можно скачать с сайта http://www.programpaketet.se/produkt/endnote/endnote_en.html.

Краткое руководство к пакету EndNote размещено на странице
http://dbserv.jinr.ru/~genis/JINR.htm.

Ж. Мусульманбеков (genis@jinr.ru)

"Содержание"

5. Информационный web-сервис
Научно-технической библиотеки ОИЯИ

Web-сайт Научно-технической библиотеки (НТБ) ОИЯИ (http://lib.jinr.ru) функционирует с 1998 г., постоянно обновляется и развивается, отражая все направления деятельности НТБ. В структуре сайта имеются следующие разделы: Информация о библиотеке, Новости, Новые поступления, Электронный каталог, Электронные журналы, Сервисы, Библиотеки и институты, Публикации об ОИЯИ.

В разделе Новые поступленияеженедельно размещаются списки новых поступлений всех публикаций в библиотечный фонд. Это электронные версии традиционных еженедельных информационных бюллетеней НТБ КНИГИ”, “ПРЕПРИНТЫ”, “СТАТЬИ”, “ЖУРНАЛЫ”. Ежеквартально формируются списки материалов конференций, симпозиумов, съездов, опубликованных в журналах, полученных НТБ ОИЯИ. По мере поступления формируются списки авторефератов диссертаций. Поддерживаются архивы списков с 1998 г. (см. http://lib.jinr.ru/archru.htm  и  http://lib.jinr.ru/arch.htm).

За весь период автоматизации в НТБ ОИЯИ сформировались два электронных каталога: один - за период с 1988 г. по 2006 г. на основе СУБД Dbase, другой - с 2000 г. по настоящее время - в Автоматизированной информационной библиотечной системе (АИБС) LiberMedia. АИБС LiberMedia была введена в эксплуатацию в 2000 г., представляет собой единый программный пакет управления библиотекой. В настоящее время база данных Dbase за период с 1988 г. по 2006 г. включает около 320 тысяч записей, доступна в сети Интернет и активно используется читателями. На 01.01.2008 г. количество библиографических описаний в АИБС LiberMedia составило 89 638, а общее количество экземпляров - 99 403.

Электронные каталоги НТБ доступны в разделе сайта Электронный каталог(http://lib.jinr.ru/cat.htm). В каталогах содержатся библиографические сведения о документах, поступивших в фонд НТБ ОИЯИ:

    • практически весь книжный фонд;

    • публикации сотрудников ОИЯИ с 1988 г.;
    • периодические издания с 1999 г.;
    • все диссертации;
    • авторефераты диссертаций с 2001 г.;
    • препринты с 1990 г.;
    • материалы конференций, опубликованные в журналах с 2001 г.;
    • журнальные статьи с 1992 г.

Содержание каталогов НТБ отражает табл. 1, из нее пользователь может получить интересующие его сведения.

Таблица 1

Содержание каталогов НТБ

 

База на основе
СУБД
Dbase

База LiberMedia
OPAC

Книги

с 1990 г. по 1999 г.

основной фонд

Периодические издания

с 1994 г. по 2000 г.

c 1999 г.

Публикации сотрудников ОИЯИ

с 1988 г. по 2001 г.

c 2002 г.

Препринты

с 1990 г. по 2001 г.

c 2002 г.

Статьи

с 1992 г. по 2006 г.

c 2007 г.

Диссертации и авторефераты

 

Диссертации - весь фонд,
авторефераты - с 2001 г.

Конференции в журналах

 

с 2001 г.

В каждом электронном каталоге (Liber и Dbase) имеется справочная система, содержащая рекомендации для пользователей. Для осуществления наиболее точного поиска реализован Рубрикатор, позволяющий автоматически вводить в поисковые поля значения тематических индексов.

Доступ к электронным каталогам Liber осуществляется с помощью шлюза WWW (Z39.50) и программного модуля Open Public Access CatalogPAC). Поиск возможен по следующим полям: Заглавие, Издательство, Автор, Серия, Рубрика. Для более сложного поиска можно применять логические операторы И, ИЛИ, И-НЕ. В поле Рубрика можно указать слова или фразу из тематических индексов Тезауруса (http://lib.jinr.ru/opac/libopac/opac.html).

С 2005 г. возможен заказ литературы в режиме on-line через модуль OPAC. Читатели - сотрудники ОИЯИ, зарегистрированные в библиотеке - со своего компьютера могут воспользоваться этой услугой, чтобы заказать имеющуюся в фондах литературу через электронный каталог (http://lib.jinr.ru/opac/elcat.php). Для заказа литературы в электронном каталоге необходимо щелкнуть на ссылку заказ, отметить отдел, куда направляется заказ, и ввести запрашиваемые системой данные: номер читательского билета и имя/отчество. Заказ будет выполнен при наличии свободного экземпляра в течение одного дня. При отсутствии литературы на момент заказа, читатель ставится в очередь. Одновременно можно заказать не более 5 наименований. В 2007 г. общее количество обращений к электронным каталогам составило около 18 тысяч.

Через раздел "Электронные журналы" читатели могут выйти на сайт “Publishing Offices over the World”, где собраны ссылки на полнотекстовые электронные версии журналов, книг, энциклопедий и справочников. Здесь также представлены ссылки на крупные издательские фирмы, научные центры, институты, серверы, поисковые системы. НТБ ОИЯИ получает 170 наименований периодических изданий, выписывает иностранные журналы, благодаря чему сотрудники ОИЯИ имеют доступ к полнотекстовым электронным версиям этих журналов через Интернет. Особенности авторизованного доступа и содержание раздела описаны выше
Ж. Мусульманбековым
.

Активно используется читателями Научная электронная библиотека РФФИ, которая предоставляет доступ к полным текстам более 3000 наименований журналов. Общее количество обращений к электронным версиям журналов через Электронную библиотеку РФФИ и через сайты зарубежных издательств составило 90 тысяч.

В разделе "Cервисы" доступны:

    • Электронные версии библиографических указателей работ сотрудников ОИЯИ с 2002 г., сформированные по тематическим разделам. Указатели содержат ссылки на полные тексты публикаций и именные указатели (author indexes).
    • Статистика о публикациях сотрудников ОИЯИ в различных журналах.
    • On-line заказ литературы через модуль OPAC.
    • Подписка на еженедельную рассылку Бюллетеня новых поступлений в НТБ ОИЯИ.

Чтобы получать электронные версии еженедельных информационных бюллетеней НТБ по электронной почте, нужно заполнить предлагаемую форму. На данный момент электронные версии информационных бюллетеней рассылаются приблизительно 100 желающим по адресам электронной почты. По мере необходимости организуется внутренняя рассылка сообщений для извещения подписавшихся пользователей о планируемых выставках, семинарах, презентациях и пр.

В 2006 г., в связи с 50-летием ОИЯИ, начат новый проект - “История ОИЯИ и г. Дубны на страницах книг, журналов и центральных газет”. Информация об этом находится в разделе "Публикации об ОИЯИ". Публикации расположены в трех разделах в хронологическом порядке: Литература об ОИЯИ,  Литература о лабораториях ОИЯИ,  Литература об ученых ОИЯИ.

Г. Коробова (korobova@jinr.ru)       
И. Филозова (Irina.Filozova@jinr.ru)


"Содержание" "Раздел II"