Kарта сайта eng
О насНовости
ДеятельностьВычислительные & информационные ресурсы
     Вычислительные & информационные ресурсы > ЦИВК     
Новости
ЦИВК
Регистрация
Статистика
Файловая система AFS (ps)
Руководство пользователя dCache
Безопасность в сети
Библиотеки
Вопросы распараллеливания
Руководство для пользователей
Практические рекомендации
Контакт
Фотогалерея
Старая версия сайта ЦИВК
Новые особенности работы пользователей

После перехода на новую ОС - SLC3, появились следующие особенности работы на машинах ЦИВК:

1. Почта
Как и прежде, мы обеспечиваем получение и отправку почты на интерактивных машинах lxpub01 -:- lxpub03 с помощью pine. В связи с переносом почтового сервера на другую машину, могут возникнуть проблемы с почтой. Для того, что бы избежать проблем, настоятельно рекомендуем выполнить следующие действия:
  • удалить старые файлы конфигурации pine и ssh:
    rm -f .pinerc .ssh/known_hosts
  • запустить pine

В настройках pine должен быть указан:
inbox-path = lxmx00.jinr.ru/novalidate-cert/
(появляется автоматически после указанной последовательности действий).

Если pine все же требует password при запуске, заведите файл .pine.pwd в своей домашней директории:
touch .pine.pwd && chmod 600 .pine.pwd
Сервер lxmx00.jinr.ru позволяет читать почту по протоколам imap и pop3 и с других машин, эта возможность только предоставляется нами, технической поддержки при настройке других программ чтения почты мы не оказываем.


2. Проблема с "mc"
У некоторых пользователей "mc" определяется в стартовом файле .bashrc как функция bash, это конфликтует с определением нового "mc" в системных стартовых файлах. Если у вас не запускается "mc", просто перепишите стандартные стартовые файлы к себе в домашнюю директорию:
cd
cp -f /etc/skel/.bashrc .
cp -f /etc/skel/.bash_profile .

3. Отсутствует "gv"
Вместо "gv" используйте "ggv".

4. Нет соединения по ftp с машинами lxpub01 -:- lxpub03
У нас есть выделенный FTP сервер, на котором смонтированы те же самые директории, что и на lxpub01 -:- lxpub03. Используйте для доступа к файлам по ftp машину ftp.jinr.ru.

Таким образом, там где вы раньше указывали:
ftp://lxpub01.jinr.ru
указывайте: ftp://ftp.jinr.ru

Все будет работать как работало прежде.
Настоятельно рекомендуем вместо FTP, который передает ваш пароль по сети в открытом виде, использовать защищенный от взлома пароль "sftp".
Для Windows он имеется в пакете putty
(ftp://linux4u.jinr.ru/pub/win9x/crypt/putty-latest/x86)


5. Запуск задач на счет в пакетную обработку (qsub)
Внимание! Для запуска задач в batch нужно запустить команду "pbspwstore" и ввести в ответ на 3 запроса 3 раза ваш AFS пароль.
Будьте предельно внимательны при вводе пароля, в случае ошибки ваши задания не смогут нормально завершаться.

В настоящее время установлено новое ПО пакетной обработки (batch) - Torque. Torque - это новая версия старого пакета PBS, все прежние команды (qsub, qdel, qstat) не изменились. В связи с появлением новых возможностей была переконфигурирована система очередей. В настоящее время для установки заданий в очередь имя очереди указывать не надо. Однако существенно возрастает значение других параметров, описанных в файле задания:
- требуемое время выполнения;
- необходимая оперативная и виртуальная память;
- количество процессоров (для задач пареллельных вычислений).
В зависимости от заданных значений, задача будет направляться в разные очереди, на разные машины, и может быть задержана в процессе выполнения на какое-то время.
Более подробное описание и тонкости вычисления приоритетов мы опубликуем в ближайшее время.
В данный момент, для запуска заданий в batch через qsub, уберите из своего скрипт файла для запуска по qsub строки с указанием:
#PBS -q ...
#PBS -l nodes=1:...


6. Доступ к данным и программам на batch машинах
На всех batch машинах созданы директории для хранения данных в процессе работы batch задания. Переменная окружения TMPDIR устанавливается при запуске задания и указывает на директорию, где задача может записывать свои данные. Из batch заданий можно переписывать данные с общих scratch директорий, которые теперь доступны непосредственно только на интерактивных машинах lxpub01 -:- lxpub03. Последовательность команд в скрипт файле должна выглядеть примерно так:

cd $TMPDIR
scp -1p cv:/scrc/u/"$USER"/progs/myprog myprog
scp -1p cv:/scrc/u/"$USER"/mydata/file.in file.in
./myprog < file.in >file.out
scp -1p file.out cv:/scrc/u/"$USER"/mydata/file.out

В ближайшее время мы организуем возможность использовать средства системы CASTOR и dCache для удаленного доступа к данным.
Специализированное ПО экспериментов и групп пользователей мы будем переносить в AFS.
К моменту написания данного документа ферма для параллельных вычислений еще не готова, не установлено специфическое ПО. Эта ферма пока используется для обычных задач.


7. Установлены CERNLIB 2004 и ROOT
Необходимые переменные среды окружения для работы с CERNLIB и ROOT устанавливаются автоматически. Для связи своих программ с библиотеками из CERNLIB рекомендуем использовать команду cernlib. Например:
      cernlib mathlib
выдаст строку со списком необходимых библиотек для программы, использующей фукции из mathlib.

8. На lxpub03 установлено ПО UI из LCG2
Если вы не знаете, что такое LCG2, то UI не представляет для вас интереса.

9. Наряду со старой версией mozilla, установлены новые программы: firefox и thunderbird.

10. Проблемы с ssh/scp/sftp
Если у вас возникают проблемы при работе с ssh клиентами, попробуйте удалить файл known_hosts:
cd
rm -f .ssh/known_hosts
   Copyright © ЛИТ, ОИЯИ , 2006
    Webmaster : @jinr.ru

|    О нас    |    Новости    |    Деятельность    |    Вычислительные & информационные ресурсы    |