Семинар

Вторник, 18 мая 2021
15:00
Конференц – зал ЛИТ, Онлайн семинар в Webex
Бутенко Юрий Александрович

Разработка информационных систем для теоретических и прикладных задач на базе платформы HybriLIT

В докладе представлен обзор двух разрабатываемых информационных систем (ИС) на базе платформы HybriLIT. Основной целью создания этих ИС является автоматизация проведения расчетов, а также обеспечение хранения и анализа данных для различных групп исследователей. Информационная система, предназначенная для проведения радиобиологических исследований, предоставляет инструментарий для хранения экспериментальных данных различных типов, набор программных средств для анализа поведенческих паттернов лабораторных животных и для изучения патоморфологических изменений в центральной нервной системе после воздействия ионизирующего излучения и других факторов. Данная ИС включает в себя блоки по хранению и предоставлению доступа к экспериментальным данным, и блок анализа данных на базе алгоритмов машинного и глубокого обучения и алгоритмов компьютерного зрения.
Также на базе платформы HybriLIT ведется разработка виртуальной исследовательской среды (ВИС) для моделирования физических процессов в сложных системах, основанных на джозефсоновских переходах. ВИС сочетает в себе удобные инструменты на базе web-технологий для создания моделей, интерфейса для проведения расчетов на гетерогенной вычислительной платформе HуbriLIT, визуализации результатов расчетов и предоставляет различным исследовательским группам среду для организации совместных исследований, обмена моделями и результатами расчетов.
Стадник Алексей Викторович

Алгоритмы для автоматизации обработки данных экспериментов радиобиологических исследований

В работе представлены результаты по разработке алгоритмического блока информационной системы, создаваемой в рамках совместного проекта ЛИТ им. М.Г. Мещерякова и ЛРБ, по автоматизации обработки экпериментальных данных радиобиологических исследований. Разработанные алгоритмы анализа данных построены на базе алгоритмов машинного и глубокого обучения и алгоритмов компьютерного зрения. Задачи анализа данных экспериментов включают в себя алгоритмы для анализа видеоматериалов и анализа изображений. В рамках анализа видеоматериалов разработаны алгоритмы автоматизированной разметки экспериментального поля установки, анализ характеристик поведения лабораторного животного в течение времени проведения эксперимента и формирование сводной информации по характеру поведения животных. Для анализа изображений разработаны алгоритмы включающие в себя сегментацию и классификацию нейронов головного мозга лабораторных животных с учетом присутствующих на изображении шумов. Представленные алгоритмы реализованы как компоненты информационной системы, предоставляющей возможности для проведения анализа различным исследовательским группам в рамках совместных исследований.

Информация о семинаре и ссылка на подключение через Webex размещены в Indico